Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms