Protein–RNA interactions for Protein: P80316

Cct5, T-complex protein 1 subunit epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct5P80316 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cct5P80316 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cct5P80316 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cct5P80316 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cct5P80316 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cct5P80316 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cct5P80316 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cct5P80316 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cct5P80316 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cct5P80316 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cct5P80316 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms