Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkn1P70268 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms