Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcbP68404 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms