Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Acta1P68134 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Acta1P68134 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Acta1P68134 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Acta1P68134 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Acta1P68134 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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