Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps3P62908 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps3P62908 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps3P62908 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps3P62908 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps3P62908 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps3P62908 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps3P62908 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms