Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp46P62069 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp46P62069 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp46P62069 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp46P62069 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp46P62069 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp46P62069 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp46P62069 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp46P62069 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp46P62069 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp46P62069 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms