Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ppfia3P60469 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ppfia3P60469 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms