Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms