Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms