Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm2P58774 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 198.6 ms