Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Paxbp1P58501 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms