Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd4P58467 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd4P58467 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd4P58467 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Setd4P58467 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Setd4P58467 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Setd4P58467 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Setd4P58467 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Setd4P58467 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Setd4P58467 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms