Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp25P57080 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp25P57080 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp25P57080 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms