Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CartptP56388 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CartptP56388 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CartptP56388 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CartptP56388 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CartptP56388 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CartptP56388 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CartptP56388 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CartptP56388 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CartptP56388 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CartptP56388 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CartptP56388 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CartptP56388 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CartptP56388 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CartptP56388 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CartptP56388 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CartptP56388 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CartptP56388 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CartptP56388 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CartptP56388 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CartptP56388 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CartptP56388 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CartptP56388 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CartptP56388 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CartptP56388 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CartptP56388 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CartptP56388 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CartptP56388 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CartptP56388 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CartptP56388 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CartptP56388 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CartptP56388 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CartptP56388 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CartptP56388 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CartptP56388 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CartptP56388 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CartptP56388 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CartptP56388 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CartptP56388 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CartptP56388 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CartptP56388 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CartptP56388 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CartptP56388 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CartptP56388 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CartptP56388 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CartptP56388 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CartptP56388 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CartptP56388 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CartptP56388 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CartptP56388 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CartptP56388 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CartptP56388 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CartptP56388 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CartptP56388 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CartptP56388 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CartptP56388 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CartptP56388 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CartptP56388 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CartptP56388 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CartptP56388 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CartptP56388 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CartptP56388 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CartptP56388 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CartptP56388 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CartptP56388 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CartptP56388 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CartptP56388 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CartptP56388 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CartptP56388 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CartptP56388 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CartptP56388 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CartptP56388 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CartptP56388 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CartptP56388 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CartptP56388 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CartptP56388 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CartptP56388 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CartptP56388 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CartptP56388 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CartptP56388 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CartptP56388 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CartptP56388 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CartptP56388 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CartptP56388 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CartptP56388 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CartptP56388 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CartptP56388 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CartptP56388 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CartptP56388 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CartptP56388 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CartptP56388 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CartptP56388 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CartptP56388 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CartptP56388 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CartptP56388 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CartptP56388 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CartptP56388 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CartptP56388 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CartptP56388 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CartptP56388 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms