Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpdP50404 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpdP50404 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpdP50404 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms