Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc13P50207 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms