Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

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Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rfx2P48379 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rfx2P48379 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rfx2P48379 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rfx2P48379 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rfx2P48379 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rfx2P48379 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rfx2P48379 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rfx2P48379 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rfx2P48379 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rfx2P48379 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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