Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NodalP43021 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NodalP43021 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NodalP43021 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NodalP43021 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NodalP43021 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NodalP43021 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NodalP43021 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NodalP43021 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NodalP43021 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NodalP43021 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NodalP43021 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NodalP43021 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NodalP43021 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NodalP43021 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NodalP43021 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NodalP43021 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NodalP43021 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NodalP43021 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NodalP43021 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NodalP43021 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NodalP43021 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NodalP43021 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NodalP43021 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NodalP43021 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NodalP43021 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NodalP43021 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NodalP43021 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NodalP43021 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NodalP43021 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NodalP43021 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NodalP43021 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NodalP43021 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NodalP43021 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NodalP43021 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NodalP43021 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NodalP43021 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NodalP43021 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NodalP43021 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NodalP43021 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NodalP43021 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NodalP43021 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NodalP43021 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NodalP43021 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NodalP43021 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NodalP43021 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NodalP43021 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NodalP43021 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NodalP43021 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NodalP43021 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NodalP43021 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NodalP43021 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NodalP43021 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NodalP43021 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NodalP43021 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms