Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ThpoP40226 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ThpoP40226 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ThpoP40226 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ThpoP40226 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ThpoP40226 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ThpoP40226 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ThpoP40226 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ThpoP40226 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ThpoP40226 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ThpoP40226 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ThpoP40226 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ThpoP40226 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
ThpoP40226 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ThpoP40226 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ThpoP40226 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ThpoP40226 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ThpoP40226 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ThpoP40226 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ThpoP40226 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ThpoP40226 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
ThpoP40226 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ThpoP40226 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ThpoP40226 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ThpoP40226 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ThpoP40226 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ThpoP40226 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ThpoP40226 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms