Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf1P39428 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf1P39428 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf1P39428 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf1P39428 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf1P39428 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf1P39428 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf1P39428 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf1P39428 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms