Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stfa3P35173 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms