Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp4P35123 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp4P35123 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp4P35123 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp4P35123 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp4P35123 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp4P35123 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp4P35123 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms