Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnd1P30999 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnd1P30999 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms