Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnd3P30282 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnd3P30282 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms