Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms