Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RxrgP28705 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrgP28705 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrgP28705 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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RxrgP28705 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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