Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col2a1P28481 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col2a1P28481 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms