Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vav1P27870 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vav1P27870 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vav1P27870 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav1P27870 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav1P27870 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav1P27870 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vav1P27870 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vav1P27870 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms