Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc5P27641 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc5P27641 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms