Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms