Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZfaP23607 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZfaP23607 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZfaP23607 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZfaP23607 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms