Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.6 ms