Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eif3aP23116 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms