Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klra1P20937 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Klra1P20937 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klra1P20937 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klra1P20937 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klra1P20937 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klra1P20937 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klra1P20937 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klra1P20937 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klra1P20937 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klra1P20937 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klra1P20937 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klra1P20937 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klra1P20937 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klra1P20937 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klra1P20937 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klra1P20937 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Klra1P20937 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klra1P20937 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klra1P20937 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klra1P20937 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klra1P20937 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klra1P20937 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klra1P20937 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klra1P20937 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klra1P20937 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klra1P20937 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klra1P20937 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klra1P20937 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klra1P20937 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klra1P20937 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Klra1P20937 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klra1P20937 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klra1P20937 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Klra1P20937 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Klra1P20937 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klra1P20937 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klra1P20937 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klra1P20937 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klra1P20937 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klra1P20937 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klra1P20937 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms