Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms