Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms