Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms