Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Hoxb1P17919 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Hoxb1P17919 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Hoxb1P17919 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Hoxb1P17919 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxb1P17919 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Hoxb1P17919 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Hoxb1P17919 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Hoxb1P17919 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms