Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ass1P16460 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ass1P16460 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ass1P16460 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ass1P16460 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ass1P16460 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ass1P16460 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ass1P16460 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms