Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calb1P12658 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calb1P12658 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calb1P12658 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calb1P12658 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Calb1P12658 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calb1P12658 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calb1P12658 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calb1P12658 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calb1P12658 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calb1P12658 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms