Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms