Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb7P09024 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms