Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa7P02830 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms