Protein–RNA interactions for Protein: O89053

Coro1a, Coronin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Coro1aO89053 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Coro1aO89053 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Coro1aO89053 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Coro1aO89053 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Coro1aO89053 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Coro1aO89053 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Coro1aO89053 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Coro1aO89053 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Coro1aO89053 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Coro1aO89053 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Coro1aO89053 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Coro1aO89053 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Coro1aO89053 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Coro1aO89053 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Coro1aO89053 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Coro1aO89053 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Coro1aO89053 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Coro1aO89053 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Coro1aO89053 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Coro1aO89053 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Coro1aO89053 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Coro1aO89053 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Coro1aO89053 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Coro1aO89053 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Coro1aO89053 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Coro1aO89053 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Coro1aO89053 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Coro1aO89053 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Coro1aO89053 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Coro1aO89053 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Coro1aO89053 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Coro1aO89053 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Coro1aO89053 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Coro1aO89053 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Coro1aO89053 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Coro1aO89053 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Coro1aO89053 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Coro1aO89053 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Coro1aO89053 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Coro1aO89053 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Coro1aO89053 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Coro1aO89053 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Coro1aO89053 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Coro1aO89053 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Coro1aO89053 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Coro1aO89053 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Coro1aO89053 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Coro1aO89053 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Coro1aO89053 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Coro1aO89053 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Coro1aO89053 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Coro1aO89053 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Coro1aO89053 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Coro1aO89053 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Coro1aO89053 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Coro1aO89053 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Coro1aO89053 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Coro1aO89053 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Coro1aO89053 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Coro1aO89053 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Coro1aO89053 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Coro1aO89053 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Coro1aO89053 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Coro1aO89053 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Coro1aO89053 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Coro1aO89053 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Coro1aO89053 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Coro1aO89053 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Coro1aO89053 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Coro1aO89053 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Coro1aO89053 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Coro1aO89053 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Coro1aO89053 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Coro1aO89053 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Coro1aO89053 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Coro1aO89053 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Coro1aO89053 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Coro1aO89053 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Coro1aO89053 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Coro1aO89053 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Coro1aO89053 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Coro1aO89053 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Coro1aO89053 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Coro1aO89053 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Coro1aO89053 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Coro1aO89053 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Coro1aO89053 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Coro1aO89053 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Coro1aO89053 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Coro1aO89053 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Coro1aO89053 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Coro1aO89053 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Coro1aO89053 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Coro1aO89053 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Coro1aO89053 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Coro1aO89053 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Coro1aO89053 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Coro1aO89053 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Coro1aO89053 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Coro1aO89053 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms