Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AvilO88398 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AvilO88398 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AvilO88398 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AvilO88398 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AvilO88398 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AvilO88398 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AvilO88398 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AvilO88398 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AvilO88398 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AvilO88398 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AvilO88398 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AvilO88398 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AvilO88398 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AvilO88398 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AvilO88398 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AvilO88398 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AvilO88398 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AvilO88398 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AvilO88398 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AvilO88398 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AvilO88398 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AvilO88398 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AvilO88398 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AvilO88398 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AvilO88398 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AvilO88398 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AvilO88398 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AvilO88398 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AvilO88398 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AvilO88398 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AvilO88398 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AvilO88398 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AvilO88398 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AvilO88398 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AvilO88398 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AvilO88398 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AvilO88398 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AvilO88398 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AvilO88398 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AvilO88398 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AvilO88398 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AvilO88398 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AvilO88398 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AvilO88398 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
AvilO88398 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AvilO88398 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AvilO88398 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AvilO88398 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AvilO88398 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AvilO88398 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AvilO88398 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AvilO88398 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AvilO88398 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AvilO88398 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AvilO88398 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AvilO88398 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AvilO88398 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AvilO88398 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AvilO88398 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms