Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnt1O88346 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms