Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3aO70157 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3aO70157 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Top3aO70157 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Top3aO70157 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3aO70157 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3aO70157 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Top3aO70157 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3aO70157 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Top3aO70157 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top3aO70157 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3aO70157 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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