Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RngttO55236 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RngttO55236 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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RngttO55236 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RngttO55236 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RngttO55236 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RngttO55236 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RngttO55236 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RngttO55236 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RngttO55236 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RngttO55236 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RngttO55236 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RngttO55236 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RngttO55236 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RngttO55236 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RngttO55236 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RngttO55236 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RngttO55236 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RngttO55236 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RngttO55236 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RngttO55236 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RngttO55236 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RngttO55236 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RngttO55236 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RngttO55236 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RngttO55236 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RngttO55236 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RngttO55236 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RngttO55236 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RngttO55236 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RngttO55236 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RngttO55236 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RngttO55236 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RngttO55236 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RngttO55236 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RngttO55236 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RngttO55236 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RngttO55236 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RngttO55236 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RngttO55236 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RngttO55236 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RngttO55236 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RngttO55236 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RngttO55236 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RngttO55236 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RngttO55236 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RngttO55236 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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