Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb2O55203 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms